La référence au MSJ au Portugal est apparue pour la première fois en l’année pastorale 1988-1989, surtout comme fruit des groupes des Amis de Dominique Savio (ADS) déjà existants dans certains centres.
Le 24 mai 1989 est publié le premier document d’orientation du Mouvement Salésien des Jeunes et de la Spiritualité Salésienne des Jeunes, qui l’identifie dès le début comme un mouvement de jeunes pour les jeunes. Dans ce document, il était déjà fait référence aux éléments significatifs et à l’organisation de la coordination du mouvement à travers une assemblée générale et un conseil national.
Pourtant, ce n’est qu’après l’an 2000 que l’Assemblée nationale du Mouvement des Jeunes Salésiens (ANMSJ) et le Conseil National du Mouvement des Jeunes Salésiens (CNMSJ) ont été créés et en 2005 a eu lieu la première participation du Conseil du MSJ portugais à une Assemblée Générale du MSJ-Europe, ce qui a également créé un nouvel élan dans le MSJ national conduisant à une nouvelle dynamique dans ces organes. En 2011, il y a une révision des structures du SYM avec le lancement d’un ensemble de subventions d’identité. En 2012, les premiers statuts et règlements du CNMJS et de l’ANMJS ont été élaborés. Selon les statuts, il y a chaque année pastorale une Assemblée générale et des réunions trimestrielles du Conseil national, et aussi souvent que nécessaire.
Les propositions de cet itinéraire éducatif s’adressent tout particulièrement aux enfants et aux jeunes âgés de 10 à 25 ans.
Parmi les différentes rencontres d’animation, de retraite et de formation qui se déroulent tout au long de l’année, il y a la Journée nationale SYM, le Camp national SYM, le festival de courts métrages Clip Don Bosco et l’Assemblée nationale.