La referencia al MJS en Portugal aparece por primera vez en el año pastoral 1988-1989, principalmente a raíz de los grupos Amigos de Domingos Sávio (ADS) ya existentes en algunos centros.
El 24 de mayo de 1989 se publicó el primer documento rector del Movimiento Juvenil Salesiano y de la Espiritualidad Juvenil Salesiana, identificándose inmediatamente como un movimiento de jóvenes para jóvenes. En este documento ya se hacía referencia a los elementos significativos ya la organización de la coordinación del movimiento a través de una asamblea general y un consejo nacional.
Aun así, sólo después del año 2000 se pone en práctica la implementación de la Asamblea Nacional del Movimiento Juvenil Salesiano (ANMJS) y del Consejo Nacional del Movimiento Juvenil Salesiano (CNMJS) y en 2005 la primera participación del consejo MJS Portugal en un general del MJS-Europa, que también crea un nuevo impulso en el MJS nacional que lleva a una dinámica renovada en estos organismos. En 2011, se llevó a cabo una revisión de las estructuras del MJS con el lanzamiento de un conjunto de subsidios de identidad. En 2012 se redactaron los primeros estatutos y reglamentos de la CNMJS y la ANMJS. Según los estatutos, en cada año pastoral hay una Asamblea General y reuniones trimestrales del Consejo Nacional y, en su momento, cuantas veces sea necesario.
Las propuestas de este itinerario educativo están especialmente dirigidas a niños y jóvenes de entre 10 y 25 años.
Entre los diversos encuentros de animación, retiro y formación realizados a lo largo del año, se destacan el Día Nacional del MJS, el Campamento Nacional del MJS, el festival de cortometrajes Clip Dom Bosco y la Asamblea Nacional.
